Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXOSC8Q96B26 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXOSC8Q96B26 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXOSC8Q96B26 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EXOSC8Q96B26 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXOSC8Q96B26 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EXOSC8Q96B26 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms