Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLUAP1Q96AJ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLUAP1Q96AJ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLUAP1Q96AJ1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLUAP1Q96AJ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLUAP1Q96AJ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLUAP1Q96AJ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLUAP1Q96AJ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLUAP1Q96AJ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLUAP1Q96AJ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLUAP1Q96AJ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLUAP1Q96AJ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLUAP1Q96AJ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CLUAP1Q96AJ1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CLUAP1Q96AJ1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLUAP1Q96AJ1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLUAP1Q96AJ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLUAP1Q96AJ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLUAP1Q96AJ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLUAP1Q96AJ1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLUAP1Q96AJ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLUAP1Q96AJ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLUAP1Q96AJ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLUAP1Q96AJ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CLUAP1Q96AJ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms