Protein–RNA interactions for Protein: Q969H8

MYDGF, Myeloid-derived growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYDGFQ969H8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MYDGFQ969H8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MYDGFQ969H8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MYDGFQ969H8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MYDGFQ969H8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYDGFQ969H8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYDGFQ969H8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYDGFQ969H8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYDGFQ969H8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms