Protein–RNA interactions for Protein: Q92793

CREBBP, CREB-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBPQ92793 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREBBPQ92793 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREBBPQ92793 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREBBPQ92793 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREBBPQ92793 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREBBPQ92793 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CREBBPQ92793 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CREBBPQ92793 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREBBPQ92793 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREBBPQ92793 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CREBBPQ92793 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREBBPQ92793 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREBBPQ92793 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREBBPQ92793 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREBBPQ92793 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREBBPQ92793 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CREBBPQ92793 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CREBBPQ92793 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CREBBPQ92793 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREBBPQ92793 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREBBPQ92793 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms