Protein–RNA interactions for Protein: Q92766

RREB1, Ras-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RREB1Q92766 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RREB1Q92766 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RREB1Q92766 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RREB1Q92766 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RREB1Q92766 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RREB1Q92766 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RREB1Q92766 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RREB1Q92766 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RREB1Q92766 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RREB1Q92766 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RREB1Q92766 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
RREB1Q92766 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RREB1Q92766 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RREB1Q92766 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RREB1Q92766 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RREB1Q92766 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RREB1Q92766 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RREB1Q92766 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RREB1Q92766 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RREB1Q92766 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
RREB1Q92766 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
RREB1Q92766 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RREB1Q92766 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RREB1Q92766 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RREB1Q92766 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RREB1Q92766 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RREB1Q92766 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RREB1Q92766 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RREB1Q92766 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RREB1Q92766 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RREB1Q92766 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RREB1Q92766 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RREB1Q92766 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RREB1Q92766 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RREB1Q92766 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RREB1Q92766 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RREB1Q92766 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RREB1Q92766 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RREB1Q92766 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RREB1Q92766 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RREB1Q92766 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RREB1Q92766 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RREB1Q92766 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RREB1Q92766 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RREB1Q92766 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
RREB1Q92766 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
RREB1Q92766 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms