Protein–RNA interactions for Protein: Q92565

RAPGEF5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF5Q92565 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAPGEF5Q92565 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAPGEF5Q92565 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAPGEF5Q92565 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAPGEF5Q92565 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAPGEF5Q92565 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RAPGEF5Q92565 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF5Q92565 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms