Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH6

RAB40A, Ras-related protein Rab-40A, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40AQ8WXH6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB40AQ8WXH6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RAB40AQ8WXH6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB40AQ8WXH6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB40AQ8WXH6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB40AQ8WXH6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB40AQ8WXH6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB40AQ8WXH6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms