Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HAVCR2Q8TDQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HAVCR2Q8TDQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAVCR2Q8TDQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAVCR2Q8TDQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HAVCR2Q8TDQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAVCR2Q8TDQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAVCR2Q8TDQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAVCR2Q8TDQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAVCR2Q8TDQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HAVCR2Q8TDQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HAVCR2Q8TDQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HAVCR2Q8TDQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms