Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OTOSQ8NHW6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOSQ8NHW6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTOSQ8NHW6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOSQ8NHW6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOSQ8NHW6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOSQ8NHW6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOSQ8NHW6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOSQ8NHW6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOSQ8NHW6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOSQ8NHW6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOSQ8NHW6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
OTOSQ8NHW6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OTOSQ8NHW6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OTOSQ8NHW6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTOSQ8NHW6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTOSQ8NHW6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOSQ8NHW6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTOSQ8NHW6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOSQ8NHW6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOSQ8NHW6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOSQ8NHW6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOSQ8NHW6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOSQ8NHW6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
OTOSQ8NHW6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms