Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF555Q8NEP9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF555Q8NEP9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF555Q8NEP9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF555Q8NEP9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF555Q8NEP9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF555Q8NEP9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF555Q8NEP9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF555Q8NEP9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF555Q8NEP9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF555Q8NEP9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF555Q8NEP9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF555Q8NEP9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF555Q8NEP9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF555Q8NEP9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF555Q8NEP9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF555Q8NEP9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF555Q8NEP9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF555Q8NEP9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF555Q8NEP9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF555Q8NEP9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF555Q8NEP9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF555Q8NEP9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms