Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FSIP1Q8NA03 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FSIP1Q8NA03 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FSIP1Q8NA03 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FSIP1Q8NA03 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FSIP1Q8NA03 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FSIP1Q8NA03 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FSIP1Q8NA03 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FSIP1Q8NA03 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FSIP1Q8NA03 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
FSIP1Q8NA03 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
FSIP1Q8NA03 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FSIP1Q8NA03 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FSIP1Q8NA03 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FSIP1Q8NA03 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FSIP1Q8NA03 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FSIP1Q8NA03 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
FSIP1Q8NA03 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
FSIP1Q8NA03 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FSIP1Q8NA03 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FSIP1Q8NA03 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FSIP1Q8NA03 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FSIP1Q8NA03 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FSIP1Q8NA03 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FSIP1Q8NA03 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
FSIP1Q8NA03 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
FSIP1Q8NA03 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FSIP1Q8NA03 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FSIP1Q8NA03 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FSIP1Q8NA03 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FSIP1Q8NA03 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FSIP1Q8NA03 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FSIP1Q8NA03 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FSIP1Q8NA03 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FSIP1Q8NA03 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FSIP1Q8NA03 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FSIP1Q8NA03 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FSIP1Q8NA03 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FSIP1Q8NA03 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FSIP1Q8NA03 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FSIP1Q8NA03 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FSIP1Q8NA03 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FSIP1Q8NA03 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FSIP1Q8NA03 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FSIP1Q8NA03 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FSIP1Q8NA03 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FSIP1Q8NA03 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FSIP1Q8NA03 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FSIP1Q8NA03 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms