Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6N3

C1orf52, UPF0690 protein C1orf52, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf52Q8N6N3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
C1orf52Q8N6N3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1orf52Q8N6N3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C1orf52Q8N6N3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf52Q8N6N3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf52Q8N6N3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf52Q8N6N3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms