Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LGI3Q8N145 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LGI3Q8N145 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LGI3Q8N145 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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LGI3Q8N145 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LGI3Q8N145 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LGI3Q8N145 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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LGI3Q8N145 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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LGI3Q8N145 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LGI3Q8N145 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGI3Q8N145 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LGI3Q8N145 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LGI3Q8N145 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LGI3Q8N145 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LGI3Q8N145 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LGI3Q8N145 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGI3Q8N145 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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