Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CACNA2D3Q8IZS8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACNA2D3Q8IZS8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNA2D3Q8IZS8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNA2D3Q8IZS8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNA2D3Q8IZS8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA2D3Q8IZS8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CACNA2D3Q8IZS8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CACNA2D3Q8IZS8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms