Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3BQ8IVW6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3BQ8IVW6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3BQ8IVW6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARID3BQ8IVW6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARID3BQ8IVW6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARID3BQ8IVW6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARID3BQ8IVW6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms