Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC43.2■■■■■ 4.51
P3H3Q8IVL6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
P3H3Q8IVL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
P3H3Q8IVL6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
P3H3Q8IVL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
P3H3Q8IVL6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
P3H3Q8IVL6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
P3H3Q8IVL6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
P3H3Q8IVL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
P3H3Q8IVL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
P3H3Q8IVL6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
P3H3Q8IVL6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
P3H3Q8IVL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
P3H3Q8IVL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
P3H3Q8IVL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.09■■■■■ 4.49
P3H3Q8IVL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
P3H3Q8IVL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.49
P3H3Q8IVL6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
P3H3Q8IVL6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
P3H3Q8IVL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC43■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.95■■■■■ 4.47
P3H3Q8IVL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
P3H3Q8IVL6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
P3H3Q8IVL6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
P3H3Q8IVL6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
P3H3Q8IVL6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
P3H3Q8IVL6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
P3H3Q8IVL6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.85■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.82■■■■■ 4.45
P3H3Q8IVL6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
P3H3Q8IVL6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
P3H3Q8IVL6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
P3H3Q8IVL6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
P3H3Q8IVL6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
P3H3Q8IVL6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
P3H3Q8IVL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
P3H3Q8IVL6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
P3H3Q8IVL6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
P3H3Q8IVL6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.73■■■■■ 4.43
P3H3Q8IVL6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
P3H3Q8IVL6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
P3H3Q8IVL6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
P3H3Q8IVL6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
P3H3Q8IVL6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
P3H3Q8IVL6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
P3H3Q8IVL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.69■■■■■ 4.42
P3H3Q8IVL6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
P3H3Q8IVL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
P3H3Q8IVL6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
P3H3Q8IVL6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
P3H3Q8IVL6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
P3H3Q8IVL6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
P3H3Q8IVL6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
P3H3Q8IVL6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
P3H3Q8IVL6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
P3H3Q8IVL6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.6■■■■■ 4.41
P3H3Q8IVL6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
P3H3Q8IVL6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
P3H3Q8IVL6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
P3H3Q8IVL6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
P3H3Q8IVL6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.4
P3H3Q8IVL6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
P3H3Q8IVL6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
P3H3Q8IVL6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
P3H3Q8IVL6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms