Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TMEM139Q8IV31 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TMEM139Q8IV31 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TMEM139Q8IV31 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMEM139Q8IV31 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM139Q8IV31 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMEM139Q8IV31 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMEM139Q8IV31 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMEM139Q8IV31 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMEM139Q8IV31 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMEM139Q8IV31 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMEM139Q8IV31 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMEM139Q8IV31 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMEM139Q8IV31 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM139Q8IV31 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM139Q8IV31 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM139Q8IV31 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMEM139Q8IV31 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMEM139Q8IV31 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMEM139Q8IV31 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMEM139Q8IV31 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMEM139Q8IV31 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMEM139Q8IV31 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMEM139Q8IV31 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMEM139Q8IV31 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms