Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP1-3Q8IUG1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRTAP1-3Q8IUG1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRTAP1-3Q8IUG1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRTAP1-3Q8IUG1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP1-3Q8IUG1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP1-3Q8IUG1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms