Protein–RNA interactions for Protein: Q86X10

RALGAPB, Ral GTPase-activating protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPBQ86X10 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
RALGAPBQ86X10 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RALGAPBQ86X10 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RALGAPBQ86X10 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RALGAPBQ86X10 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RALGAPBQ86X10 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RALGAPBQ86X10 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RALGAPBQ86X10 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RALGAPBQ86X10 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RALGAPBQ86X10 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
RALGAPBQ86X10 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RALGAPBQ86X10 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
RALGAPBQ86X10 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
RALGAPBQ86X10 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
RALGAPBQ86X10 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RALGAPBQ86X10 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RALGAPBQ86X10 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RALGAPBQ86X10 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RALGAPBQ86X10 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
RALGAPBQ86X10 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RALGAPBQ86X10 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RALGAPBQ86X10 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RALGAPBQ86X10 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
RALGAPBQ86X10 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms