Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNEQ86WN2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IFNEQ86WN2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IFNEQ86WN2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNEQ86WN2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IFNEQ86WN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IFNEQ86WN2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNEQ86WN2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
IFNEQ86WN2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNEQ86WN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IFNEQ86WN2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IFNEQ86WN2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFNEQ86WN2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFNEQ86WN2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFNEQ86WN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNEQ86WN2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNEQ86WN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNEQ86WN2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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