Protein–RNA interactions for Protein: Q86UE6

LRRTM1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1Q86UE6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRTM1Q86UE6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRTM1Q86UE6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRTM1Q86UE6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM1Q86UE6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRTM1Q86UE6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM1Q86UE6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRTM1Q86UE6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRTM1Q86UE6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM1Q86UE6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM1Q86UE6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRTM1Q86UE6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRTM1Q86UE6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRTM1Q86UE6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM1Q86UE6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM1Q86UE6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM1Q86UE6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms