Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
PBRM1Q86U86 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
PBRM1Q86U86 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
PBRM1Q86U86 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.14■■■■■ 4.82
PBRM1Q86U86 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.81
PBRM1Q86U86 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
PBRM1Q86U86 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
PBRM1Q86U86 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
PBRM1Q86U86 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
PBRM1Q86U86 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
PBRM1Q86U86 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC45.04■■■■■ 4.8
PBRM1Q86U86 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
PBRM1Q86U86 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC44.99■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
PBRM1Q86U86 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC44.93■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC44.93■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
PBRM1Q86U86 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
PBRM1Q86U86 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
PBRM1Q86U86 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
PBRM1Q86U86 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC44.86■■■■■ 4.77
PBRM1Q86U86 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
PBRM1Q86U86 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
PBRM1Q86U86 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
PBRM1Q86U86 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
PBRM1Q86U86 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
PBRM1Q86U86 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
PBRM1Q86U86 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
PBRM1Q86U86 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
PBRM1Q86U86 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.77■■■■■ 4.76
PBRM1Q86U86 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
PBRM1Q86U86 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
PBRM1Q86U86 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
PBRM1Q86U86 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
PBRM1Q86U86 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
PBRM1Q86U86 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
PBRM1Q86U86 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
PBRM1Q86U86 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
PBRM1Q86U86 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
PBRM1Q86U86 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
PBRM1Q86U86 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
PBRM1Q86U86 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
PBRM1Q86U86 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.75
PBRM1Q86U86 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
PBRM1Q86U86 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
PBRM1Q86U86 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
PBRM1Q86U86 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
PBRM1Q86U86 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
PBRM1Q86U86 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
PBRM1Q86U86 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
PBRM1Q86U86 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
PBRM1Q86U86 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
PBRM1Q86U86 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
PBRM1Q86U86 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
PBRM1Q86U86 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.55■■■■■ 4.72
PBRM1Q86U86 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
PBRM1Q86U86 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
PBRM1Q86U86 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
PBRM1Q86U86 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC44.52■■■■■ 4.72
PBRM1Q86U86 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
PBRM1Q86U86 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
PBRM1Q86U86 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
PBRM1Q86U86 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
PBRM1Q86U86 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
PBRM1Q86U86 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms