Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5B4

RIC3, Protein RIC-3, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC3Q7Z5B4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIC3Q7Z5B4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIC3Q7Z5B4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIC3Q7Z5B4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RIC3Q7Z5B4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
RIC3Q7Z5B4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIC3Q7Z5B4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIC3Q7Z5B4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIC3Q7Z5B4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIC3Q7Z5B4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms