Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RD3Q7Z3Z2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RD3Q7Z3Z2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RD3Q7Z3Z2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RD3Q7Z3Z2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RD3Q7Z3Z2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RD3Q7Z3Z2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RD3Q7Z3Z2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms