Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC46A3Q7Z3Q1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A3Q7Z3Q1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A3Q7Z3Q1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A3Q7Z3Q1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A3Q7Z3Q1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC46A3Q7Z3Q1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC46A3Q7Z3Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC46A3Q7Z3Q1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC46A3Q7Z3Q1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC46A3Q7Z3Q1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC46A3Q7Z3Q1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A3Q7Z3Q1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A3Q7Z3Q1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A3Q7Z3Q1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC46A3Q7Z3Q1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A3Q7Z3Q1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC46A3Q7Z3Q1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms