Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI0

OTOG, Otogelin, humanhuman

Predictions only

Length 2,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOGQ6ZRI0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOGQ6ZRI0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOGQ6ZRI0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOGQ6ZRI0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
OTOGQ6ZRI0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOGQ6ZRI0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOGQ6ZRI0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOGQ6ZRI0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTOGQ6ZRI0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOGQ6ZRI0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOGQ6ZRI0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOGQ6ZRI0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTOGQ6ZRI0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTOGQ6ZRI0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms