Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQR2

CFAP77, Cilia- and flagella-associated protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP77Q6ZQR2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP77Q6ZQR2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP77Q6ZQR2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP77Q6ZQR2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP77Q6ZQR2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP77Q6ZQR2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP77Q6ZQR2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 341.2 ms