Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf54Q6X4T0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf54Q6X4T0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C12orf54Q6X4T0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C12orf54Q6X4T0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C12orf54Q6X4T0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C12orf54Q6X4T0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C12orf54Q6X4T0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf54Q6X4T0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms