Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CASC1Q6TDU7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CASC1Q6TDU7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CASC1Q6TDU7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CASC1Q6TDU7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CASC1Q6TDU7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CASC1Q6TDU7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CASC1Q6TDU7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CASC1Q6TDU7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASC1Q6TDU7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CASC1Q6TDU7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CASC1Q6TDU7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CASC1Q6TDU7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CASC1Q6TDU7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CASC1Q6TDU7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CASC1Q6TDU7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CASC1Q6TDU7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CASC1Q6TDU7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CASC1Q6TDU7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CASC1Q6TDU7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CASC1Q6TDU7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CASC1Q6TDU7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CASC1Q6TDU7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CASC1Q6TDU7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CASC1Q6TDU7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CASC1Q6TDU7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CASC1Q6TDU7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CASC1Q6TDU7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CASC1Q6TDU7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CASC1Q6TDU7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CASC1Q6TDU7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CASC1Q6TDU7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CASC1Q6TDU7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CASC1Q6TDU7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms