Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATAD2Q6PL18 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATAD2Q6PL18 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATAD2Q6PL18 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
ATAD2Q6PL18 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
ATAD2Q6PL18 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
ATAD2Q6PL18 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
ATAD2Q6PL18 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
ATAD2Q6PL18 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
ATAD2Q6PL18 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
ATAD2Q6PL18 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATAD2Q6PL18 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATAD2Q6PL18 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATAD2Q6PL18 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
ATAD2Q6PL18 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATAD2Q6PL18 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATAD2Q6PL18 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATAD2Q6PL18 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATAD2Q6PL18 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATAD2Q6PL18 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATAD2Q6PL18 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATAD2Q6PL18 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
ATAD2Q6PL18 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATAD2Q6PL18 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATAD2Q6PL18 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ATAD2Q6PL18 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ATAD2Q6PL18 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATAD2Q6PL18 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATAD2Q6PL18 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
ATAD2Q6PL18 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ATAD2Q6PL18 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ATAD2Q6PL18 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
ATAD2Q6PL18 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATAD2Q6PL18 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATAD2Q6PL18 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATAD2Q6PL18 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATAD2Q6PL18 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATAD2Q6PL18 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATAD2Q6PL18 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ATAD2Q6PL18 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ATAD2Q6PL18 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ATAD2Q6PL18 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ATAD2Q6PL18 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ATAD2Q6PL18 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ATAD2Q6PL18 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms