Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF613Q6PF04 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF613Q6PF04 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF613Q6PF04 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF613Q6PF04 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF613Q6PF04 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF613Q6PF04 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms