Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF549Q6P9A3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF549Q6P9A3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF549Q6P9A3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF549Q6P9A3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF549Q6P9A3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF549Q6P9A3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms