Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT80Q6KB66 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT80Q6KB66 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT80Q6KB66 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT80Q6KB66 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT80Q6KB66 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT80Q6KB66 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms