Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPECC1LQ69YQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SPECC1LQ69YQ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPECC1LQ69YQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPECC1LQ69YQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPECC1LQ69YQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPECC1LQ69YQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SPECC1LQ69YQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPECC1LQ69YQ0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPECC1LQ69YQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPECC1LQ69YQ0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPECC1LQ69YQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPECC1LQ69YQ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPECC1LQ69YQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPECC1LQ69YQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPECC1LQ69YQ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPECC1LQ69YQ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPECC1LQ69YQ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPECC1LQ69YQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SPECC1LQ69YQ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPECC1LQ69YQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SPECC1LQ69YQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPECC1LQ69YQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPECC1LQ69YQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPECC1LQ69YQ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPECC1LQ69YQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPECC1LQ69YQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPECC1LQ69YQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPECC1LQ69YQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPECC1LQ69YQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms