Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rasa3Q60790 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rasa3Q60790 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Rasa3Q60790 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rasa3Q60790 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rasa3Q60790 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rasa3Q60790 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rasa3Q60790 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rasa3Q60790 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rasa3Q60790 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rasa3Q60790 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rasa3Q60790 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rasa3Q60790 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rasa3Q60790 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rasa3Q60790 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rasa3Q60790 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rasa3Q60790 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rasa3Q60790 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rasa3Q60790 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rasa3Q60790 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rasa3Q60790 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rasa3Q60790 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rasa3Q60790 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rasa3Q60790 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rasa3Q60790 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rasa3Q60790 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rasa3Q60790 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rasa3Q60790 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rasa3Q60790 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rasa3Q60790 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rasa3Q60790 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rasa3Q60790 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rasa3Q60790 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rasa3Q60790 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rasa3Q60790 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rasa3Q60790 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rasa3Q60790 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rasa3Q60790 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rasa3Q60790 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rasa3Q60790 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rasa3Q60790 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rasa3Q60790 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rasa3Q60790 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rasa3Q60790 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rasa3Q60790 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rasa3Q60790 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rasa3Q60790 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rasa3Q60790 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rasa3Q60790 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rasa3Q60790 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rasa3Q60790 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rasa3Q60790 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rasa3Q60790 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rasa3Q60790 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rasa3Q60790 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rasa3Q60790 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rasa3Q60790 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rasa3Q60790 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rasa3Q60790 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rasa3Q60790 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rasa3Q60790 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rasa3Q60790 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rasa3Q60790 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rasa3Q60790 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rasa3Q60790 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rasa3Q60790 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rasa3Q60790 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rasa3Q60790 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rasa3Q60790 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rasa3Q60790 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rasa3Q60790 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rasa3Q60790 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms