RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000096127.10

Ccdc50-202, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc50, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa54,64■■■■■ 6,34
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 NischQ80TM9 1593 aa53,93■■■■■ 6,22
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Abcc9P70170 1546 aa52,25■■■■■ 5,95
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Abcc8B2RUS7 1588 aa52,14■■■■■ 5,94
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 ScribQ80U72 1612 aa50,13■■■■■ 5,62
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 NacadQ5SWP3 1504 aa48,67■■■■■ 5,38
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Kdm5dQ62240 1548 aa48,53■■■■■ 5,36
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Dcaf1Q80TR8 1506 aa48,14■■■■■ 5,3
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Sycp2Q9CUU3 1500 aa47,7■■■■■ 5,23
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46,99■■■■■ 5,11
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 BicraF8VPZ9 1578 aa46,95■■■■■ 5,11
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Rhox8Q6VSS7 320 aa46,59■■■■■ 5,05
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46,46■■■■■ 5,03
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Baz1aO88379 1555 aa46,39■■■■■ 5,02
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Crybg2B7ZCC2 1516 aa46,34■■■■■ 5,01
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP45,72■■■■■ 4,91
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP45,61■■■■■ 4,89
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa45,35■■■■■ 4,85
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP45,3■■■■■ 4,84
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP45,21■■■■■ 4,83
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Smarca2Q6DIC0 1577 aa45,05■■■■■ 4,8
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP44,93■■■■■ 4,78
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa44,78■■■■■ 4,76
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Ercc6F8VPZ5 1481 aa44,69■■■■■ 4,74
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa44,65■■■■■ 4,74
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa44,43■■■■■ 4,7
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Rtl1Q7M732 1744 aa44,32■■■■■ 4,69
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Wdr62Q3U3T8 1523 aa44,28■■■■■ 4,68
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Fam135aQ6NS59 1506 aa44,25■■■■■ 4,67
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Frmpd1A2AKB4 1549 aa44,19■■■■■ 4,67
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP43,99■■■■■ 4,63
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Baz1bQ9Z277 1479 aa43,96■■■■■ 4,63
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 CftrP26361 1476 aa43,89■■■■■ 4,62
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP43,84■■■■■ 4,61
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43,79■■■■■ 4,6
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Synj1Q8CHC4 1574 aa43,71■■■■■ 4,59
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa43,58■■■■■ 4,57
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Ubl4bQ9CQ84 188 aa43,48■■■■■ 4,55
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Unc13aQ4KUS2 1712 aa43,47■■■■■ 4,55
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Mrc2Q64449 1479 aa43,19■■■■■ 4,51
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Trim41Q5NCC3 630 aa43,1■■■■■ 4,49
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP42,99■■■■■ 4,47
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP42,8■■■■■ 4,44
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Kif15Q6P9L6 1387 aa42,65■■■■■ 4,42
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Cux2P70298 1426 aa42,59■■■■■ 4,41
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Lamc3Q9R0B6 1581 aa42,56■■■■■ 4,4
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Golga3P55937 1487 aa42,3■■■■■ 4,36
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Top2bQ64511 1612 aa42,21■■■■■ 4,35
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa42,15■■■■■ 4,34
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP42,15■■■■■ 4,34
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Kif21aQ9QXL2 1672 aa42,15■■■■■ 4,34
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 TnnQ80Z71 1560 aa42,13■■■■■ 4,33
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Cep164Q5DU05 1446 aa42,07■■■■■ 4,33
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Cngb1E1AZ71 1325 aa41,96■■■■■ 4,31
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Ccdc18Q640L5 1455 aa41,94■■■■■ 4,3
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Fmn1Q05860 1466 aa41,83■■■■■ 4,29
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Camsap1A2AHC3 1581 aa41,78■■■■■ 4,28
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP41,73■■■■■ 4,27
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP41,72■■■■■ 4,27
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Il27Q8K3I6 234 aa41,65■■■■■ 4,26
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP41,63■■■■■ 4,25
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP41,58■■■■■ 4,25
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Plb1Q3TTY0 1478 aa41,53■■■■■ 4,24
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Crocc2F6XLV1 1638 aa41,49■■■■■ 4,23
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP41,48■■■■■ 4,23
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Dnajc5P60904 198 aa41,45■■■■■ 4,23
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Ift140E9PY46 1464 aa41,26■■■■■ 4,2
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Grin2bQ01097 1482 aa41,26■■■■■ 4,2
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Duox2A2AQ99 1517 aa41,25■■■■■ 4,19
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa41,12■■■■■ 4,17
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Shroom2A2ALU4 1481 aa41,1■■■■■ 4,17
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Efcab5A0JP43 1406 aa41,06■■■■■ 4,16
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Rusc2Q80U22 1514 aa41,03■■■■■ 4,16
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP41,01■■■■■ 4,16
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Disp1Q3TDN0 1521 aa40,94■■■■■ 4,14
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 NrkQ9R0G8 1455 aa40,9■■■■■ 4,14
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Samd9lQ69Z37 1561 aa40,88■■■■■ 4,13
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP40,81■■■■■ 4,12
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP40,8■■■■■ 4,12
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Chic1Q8CBW7 227 aa40,8■■■■■ 4,12
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa40,76■■■■■ 4,11
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Shroom4Q1W617 1475 aa40,65■■■■■ 4,1
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP40,65■■■■■ 4,1
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Rad54l2Q99NG0 1466 aa40,58■■■■■ 4,09
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 PtprkP35822 1457 aa40,56■■■■■ 4,08
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Setd1bQ8CFT2 1985 aa40,55■■■■■ 4,08
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Grin2aP35436 1464 aa40,54■■■■■ 4,08
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Magi3Q9EQJ9 1476 aa40,54■■■■■ 4,08
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Col17a1Q07563 1470 aa40,44■■■■■ 4,06
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP40,44■■■■■ 4,06
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Gpatch8A2A6A1 1505 aa40,43■■■■■ 4,06
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 SynmQ70IV5 1561 aa40,39■■■■■ 4,06
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Pla2r1Q62028 1487 aa40,32■■■■■ 4,04
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP40,3■■■■■ 4,04
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Fgd6Q69ZL1 1399 aa40,26■■■■■ 4,04
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 HrcG5E8J6 738 aa40,24■■■■■ 4,03
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP40,17■■■■■ 4,02
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Zeb1Q64318 1117 aa40,13■■■■■ 4,01
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa40,12■■■■■ 4,01
Ccdc50-202ENSMUST00000096127 Npm2Q80W85 207 aa40,04■■■■■ 4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,5 ms