Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM208BQ5VWN6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM208BQ5VWN6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM208BQ5VWN6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM208BQ5VWN6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM208BQ5VWN6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM208BQ5VWN6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM208BQ5VWN6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM208BQ5VWN6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM208BQ5VWN6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM208BQ5VWN6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM208BQ5VWN6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM208BQ5VWN6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
FAM208BQ5VWN6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM208BQ5VWN6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM208BQ5VWN6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM208BQ5VWN6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM208BQ5VWN6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAM208BQ5VWN6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM208BQ5VWN6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAM208BQ5VWN6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM208BQ5VWN6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAM208BQ5VWN6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM208BQ5VWN6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM208BQ5VWN6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM208BQ5VWN6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM208BQ5VWN6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM208BQ5VWN6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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