Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARFGEF3Q5TH69 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARFGEF3Q5TH69 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARFGEF3Q5TH69 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARFGEF3Q5TH69 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFGEF3Q5TH69 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFGEF3Q5TH69 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms