Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PXDC1Q5TGL8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PXDC1Q5TGL8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PXDC1Q5TGL8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PXDC1Q5TGL8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PXDC1Q5TGL8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PXDC1Q5TGL8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms