Protein–RNA interactions for Protein: Q5T481

RBM20, RNA-binding protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20Q5T481 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RBM20Q5T481 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RBM20Q5T481 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RBM20Q5T481 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM20Q5T481 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RBM20Q5T481 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM20Q5T481 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM20Q5T481 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms