Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIF1Q5T3J3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRIF1Q5T3J3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRIF1Q5T3J3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIF1Q5T3J3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIF1Q5T3J3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIF1Q5T3J3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRIF1Q5T3J3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRIF1Q5T3J3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIF1Q5T3J3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRIF1Q5T3J3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRIF1Q5T3J3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRIF1Q5T3J3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRIF1Q5T3J3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRIF1Q5T3J3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIF1Q5T3J3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIF1Q5T3J3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIF1Q5T3J3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIF1Q5T3J3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIF1Q5T3J3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIF1Q5T3J3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIF1Q5T3J3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIF1Q5T3J3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms