Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP188Q5SRE5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NUP188Q5SRE5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUP188Q5SRE5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NUP188Q5SRE5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUP188Q5SRE5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUP188Q5SRE5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NUP188Q5SRE5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NUP188Q5SRE5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUP188Q5SRE5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NUP188Q5SRE5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NUP188Q5SRE5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUP188Q5SRE5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUP188Q5SRE5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUP188Q5SRE5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUP188Q5SRE5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NUP188Q5SRE5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NUP188Q5SRE5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NUP188Q5SRE5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NUP188Q5SRE5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
NUP188Q5SRE5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NUP188Q5SRE5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NUP188Q5SRE5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NUP188Q5SRE5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NUP188Q5SRE5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP188Q5SRE5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP188Q5SRE5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NUP188Q5SRE5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NUP188Q5SRE5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NUP188Q5SRE5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP188Q5SRE5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NUP188Q5SRE5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP188Q5SRE5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP188Q5SRE5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP188Q5SRE5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP188Q5SRE5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP188Q5SRE5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP188Q5SRE5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP188Q5SRE5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP188Q5SRE5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP188Q5SRE5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NUP188Q5SRE5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP188Q5SRE5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NUP188Q5SRE5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NUP188Q5SRE5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NUP188Q5SRE5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NUP188Q5SRE5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NUP188Q5SRE5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms