Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HABP4Q5JVS0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HABP4Q5JVS0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HABP4Q5JVS0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HABP4Q5JVS0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HABP4Q5JVS0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
HABP4Q5JVS0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
HABP4Q5JVS0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HABP4Q5JVS0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HABP4Q5JVS0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HABP4Q5JVS0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HABP4Q5JVS0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HABP4Q5JVS0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
HABP4Q5JVS0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HABP4Q5JVS0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HABP4Q5JVS0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HABP4Q5JVS0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HABP4Q5JVS0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HABP4Q5JVS0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HABP4Q5JVS0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HABP4Q5JVS0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HABP4Q5JVS0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HABP4Q5JVS0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HABP4Q5JVS0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
HABP4Q5JVS0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HABP4Q5JVS0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HABP4Q5JVS0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HABP4Q5JVS0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HABP4Q5JVS0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HABP4Q5JVS0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HABP4Q5JVS0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HABP4Q5JVS0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HABP4Q5JVS0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms