Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM1Q5H8C1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM1Q5H8C1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM1Q5H8C1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM1Q5H8C1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM1Q5H8C1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM1Q5H8C1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM1Q5H8C1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FREM1Q5H8C1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FREM1Q5H8C1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FREM1Q5H8C1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FREM1Q5H8C1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FREM1Q5H8C1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FREM1Q5H8C1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FREM1Q5H8C1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FREM1Q5H8C1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FREM1Q5H8C1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FREM1Q5H8C1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FREM1Q5H8C1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms