Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CMPK2Q5EBM0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CMPK2Q5EBM0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CMPK2Q5EBM0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CMPK2Q5EBM0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CMPK2Q5EBM0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CMPK2Q5EBM0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CMPK2Q5EBM0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms