Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TDRD12Q587J7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TDRD12Q587J7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TDRD12Q587J7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TDRD12Q587J7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TDRD12Q587J7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TDRD12Q587J7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TDRD12Q587J7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TDRD12Q587J7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TDRD12Q587J7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TDRD12Q587J7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TDRD12Q587J7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TDRD12Q587J7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TDRD12Q587J7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TDRD12Q587J7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TDRD12Q587J7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TDRD12Q587J7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TDRD12Q587J7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TDRD12Q587J7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TDRD12Q587J7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TDRD12Q587J7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TDRD12Q587J7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TDRD12Q587J7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TDRD12Q587J7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TDRD12Q587J7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TDRD12Q587J7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TDRD12Q587J7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TDRD12Q587J7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TDRD12Q587J7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TDRD12Q587J7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TDRD12Q587J7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TDRD12Q587J7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TDRD12Q587J7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TDRD12Q587J7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TDRD12Q587J7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TDRD12Q587J7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD12Q587J7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD12Q587J7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD12Q587J7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TDRD12Q587J7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TDRD12Q587J7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TDRD12Q587J7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TDRD12Q587J7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TDRD12Q587J7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms