Protein–RNA interactions for Protein: Q53EP0

FNDC3B, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3BQ53EP0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNDC3BQ53EP0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FNDC3BQ53EP0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FNDC3BQ53EP0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FNDC3BQ53EP0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FNDC3BQ53EP0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FNDC3BQ53EP0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNDC3BQ53EP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms