Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDCD4Q53EL6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCD4Q53EL6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDCD4Q53EL6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDCD4Q53EL6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD4Q53EL6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD4Q53EL6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD4Q53EL6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD4Q53EL6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD4Q53EL6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD4Q53EL6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD4Q53EL6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD4Q53EL6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD4Q53EL6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD4Q53EL6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD4Q53EL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD4Q53EL6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD4Q53EL6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCD4Q53EL6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms