Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFTN2Q52LD8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFTN2Q52LD8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFTN2Q52LD8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFTN2Q52LD8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RFTN2Q52LD8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFTN2Q52LD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFTN2Q52LD8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFTN2Q52LD8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RFTN2Q52LD8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFTN2Q52LD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFTN2Q52LD8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFTN2Q52LD8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFTN2Q52LD8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFTN2Q52LD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFTN2Q52LD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFTN2Q52LD8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFTN2Q52LD8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFTN2Q52LD8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFTN2Q52LD8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFTN2Q52LD8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFTN2Q52LD8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFTN2Q52LD8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFTN2Q52LD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFTN2Q52LD8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFTN2Q52LD8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFTN2Q52LD8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN2Q52LD8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms