Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LINC00303Q3SY05 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LINC00303Q3SY05 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC00303Q3SY05 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC00303Q3SY05 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00303Q3SY05 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00303Q3SY05 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC00303Q3SY05 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms